Нэг молиболын технологи дээр удирдагчид
Хэдийгээр мэдрэг байдал, хурд, авах дарааллын хэмжээг хязгаарласан боловч PNAS-д тайлбарласан шинэ дарааллын арга нь шинэ бөгөөд профессороос технологидоо хөрөнгө оруулах талаархи хөрөнгө оруулагчдын нүдэнд хүрэх хангалттай амлалтыг харуулсан. Урт хугацааны ажилтан, судалгааны ахлах захирал доктор Тимоти Харрис ... хөрөнгө оруулагчид ихэвчлэн ойртдоггүй учраас энэ нь хөрөнгө оруулагчдын эрэлхийлэх арга барилтай холбоотой ямар нэг зүйл байсан байх. Эрдэмтэд, энэ бол өөр арга юм !
2003 оны 4-р сарын 1-нд PNAS хэвлэлийн мэдээг 2003 оны 4-р сарын 1-нд гаргасан бөгөөд 2003 оны 12-р сарын 19-нд шинэ компанийг санхүүжүүлэх анхны санхүүжилтийг 2004 оны 1-р сарын 2-нд эхлүүлсэн бөгөөд Хеликос 5 ажилтантай, түүний дотор Др. Харрис хэмжилтийн шинжлэх ухаан, нэг молекулын технологийн мэргэжилтэн. Хеликос одоо АНУ-ын Кэмбриджийн Мас хотод байрладаг бөгөөд хөрөнгө оруулалтын санхүүжилтийн 2 үе шаттай бөгөөд 2007 оны 5-р сарын 27-нд IPO-г нийтэд зарлаад байна.
Helicos нь генетикийн шинжилгээний технологи, тухайлбал, M13 вирусын геномын дарааллыг баталгаажуулсан True Single-Molecule Sequencing (tSMS TM ) технологид мэргэшсэн бөгөөд 2008 оны 4-р сард шинжлэх ухааны сэтгүүлд тайлбарлав. ТСМТ-ийн тусгай платформ нь HeliScope TM Single Molecule Sequencer .
Др. Харрисын бичсэнээр энэ төсөл 2004 оны 1-р сард эхэлсэн бөгөөд 2005 оны 6-р сард шинжлэх ухааны баримт бичигт тайлбарласан М13 вирүсийг амжилттай эмчилсэн дарааллын дагуу амжилтанд хүрсэн.
TMSMS TM хэрхэн ажилладаг вэ?
100-200 хос суурьтай ДНХ-ийн хэлхээ нь хязгаарлагдмал ферментийг ашиглан жижиг хэсгүүдэд хуваагддаг ба polyA-ийн сүүлийг нэмдэг. Богиносгосон туузыг дараа нь Холикос урсгалын хавтанг эрлийзжүүлж, олон тооны олон полиэтилелийн гинж нь гадаргуудаа унасан байдаг. Гибриджуулсан загвар бүрийг нэг дор дараалан оруулна. Тиймээс нэг тэрбум доллар уншиж болно. Лабеллинг нь 4 максимум бааз тус бүрт 4 циклээс бүрдсэн "квадратууд" -д явагдана . Флюресцент шошготой суурийг нэмж, багаж дээр байгаа лазер нь шошгоныг гэрэлтүүлж, тухайн туузыг үндсэн шошго дээр суурилуулсан туузыг уншиж өгдөг. Шошгыг дараа нь хугалж, дараагийн мөчлөг нь шинэ суурьтай эхэлнэ. Урсдаг эсийг суурь бүрт (4 мөчлөгөөр) эмчилсэний дараа дөрвөл нь бүрэн хийгдэж, шинэ нуклеотидын суурьтай дахин эхэлнэ.
Одоогоор HeliScope ™ нь 55 орчим хос урттай ДНХ-ийн хэсгүүдийг унших боломжтой. Дэс дарааллын илүү олон суурь нь дээжинд ашиглаж болох туушмын хувь хэмжээг багасгана. Учир нь зарим эд анги нь процессын явцад сунаж тогтохоо больсон.
20 ба түүнээс дээш сууриудыг уншихын тулд тэдгээрийн 86% -ийг ашиглаж болно. Удаан хугацааны уншилт (55+ суурь хос) энэ хувь нь ойролцоогоор 50% хүртэл буурдаг.
Нэг-Молекулын давуу тал
Хэд хэдэн бусад компани нь өндөр нэвтрүүлэх платформууд, янз бүрийн урвалжууд, харьцуулж болохуйц зардлууд, 25-40 суурь хосуудын богино унших чадвар бүхий төрөл бүрийн дараалал-synthesis технологиудыг санал болгодог боловч зөвхөн Хеликос патенттай хамт ДНХ-ийн нуклеотидын дарааллыг нэг уншдаг нэг молекул дээр уншигдахад хангалттай мэдрэмжтэй шошгололтын техник. Бусад аргууд нь ДНХ-ийг олшрохоос өмнө хэд хэдэн (сая) хувийг хувилахын тулд ( ПГУ-аар ) шаарддаг. Энэ нь олшрох явцад полимеразын энзимээр боловсруулалтын алдаанаас болж мэдэгдэхүйц хэмжээний алдаа гарах магадлалтайг харуулж байна.
2008 оны 4-р сарын байдлаар HeliScopeTM нь өдөрт олон тэрбум нуклеотидын суурийг дараалан байрлуулах боломжтой болсон.
Хеликос бол Хувь Хүнд анагаахын эвслийн гишүүн бөгөөд "1000 $ геном" буцалтгүй тусламжийг авсан. Нэгэн өдөр 1000 $ геном нь цагт хэдэн тэрбум суурь боловсруулалт хийхийг шаарддаг зорилтот зорилт юм. Одоогийн байдлаар протеноторын дараалал нь олон жилийн турш 1000 доллараас илүү үнэтэй геномыг тодорхойлохын тулд олон жил шаардагдана.
TSMSTM технологийн хэрэглээ нь өвчний үүсгэх шалтгааныг тодорхойлох, бактерийн антибиотик эсэргүүцэл, вирусын халдвар авах чадвар зэрэг олон төрлийн генетикийн хувилбаруудыг илрүүлэх явдал юм. Нэмэлт генийг илрүүлэх чадвар нь байгаль орчны микробиологийн хувьд олон боломжит хэрэглээтэй байдаг. Учир нь генетикийн арга нь өнөөгийн аргаар тусгаарлахыг хориглодог хөрс болон бусад матрицад хамаарах амьдрах чадвартай, соёлтой бус бичил биетнийг илрүүлэхэд ихэвчлэн ашигладаг. Цаашилбал, хүрээлэн буй орчны дээжийн шинж чанар нь бохирдлын асуудлаас болж ПГУ-аар ген олшроход хүндрэл учруулдаг. Гэхдээ эдгээр хүндрэлүүд нь tSMSTM-д ашиглагддаг полимеразын ферментүүдийг хөндлөнгийн оролцоогүйгээр ажиллуулахын тулд даван туулах шаардлагатай болно.
Нэг молекулын дарааллын цаана онолын хувьд нэлээд үндэслэлтэй байдаг бөгөөд хэн ч үүнийг өмнө нь бодож байгаагүй юм болов уу. Хэдийгээр энэ нь энгийн хялбар сонсогдож байгаа боловч иймэрхүү платформуудыг хөгжүүлэхэд техникийн олон бүрэлдэхүүн хэсгүүд байдаг бөгөөд Хирикос завгүй, олон тооны шинэ химийн урвалууд, урвалжууд, хавтангууд болон өндөр бүтээмж бүхий уншигчдыг хөгжүүлэх зэрэг олон бэрхшээлүүдтэй тулгарч байна. Нэг суурь дээр нэг шошгоны флюресцент илрүүлэх чадвар маш өндөр мэдрэмжит багаж хэрэгсэл шаарддаг бөгөөд дохионы дохиолол болон дохиоллын химийн хувьд хөндлөнгийн хяналтыг багасгах, хөдөлгөөнгүй загваруудад зориулж ДНХ полимеразын үнэнч байдлыг оновчтой болгох , нуклеотидууд. Эдгээр нь Хирикосын өмнө тулгараад буй зарим бэрхшээлүүд юм. Энэ технологийг хэзээ нэгэн цагт 1000 доллар, 1 өдрийн геномыг хүргэх найдварыг бий болгож байна.